Hola compañero.
Después de más de un año con mi transformer me animé a rootearla. Lo hice con el siguiente método. Es facilísimo y no tardé más de 5 min en completar el proceso. Está en inglés, pero se entiende perfectamente. Me dejó la tablet rooteada con ICS y todo lo que tenía instalado sin tocar. Otra historia es meterle una nueva rom, que ya implica wipes con pérdida de datos, pero para eso está el Titanium backup.
Te dejo el post:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=392563
Además tuve necesidad de volver al origen y utilicé este otro hilo:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=624009
La tablet se me quedó como recien comprada y sin root. Además se actualizó correctamente hasta ICS.
Espero que te funcione tan bien como a mi.
Suerte.