De ahi viene el resto de los problemas al no reconocerte la sdcard no es capaz de leer la informacion que contiene /dev y por eso estas sin wifi y sin imei y otras cosas. Por alguna razon tienes algun fichero corrupto o mil cosas. Dudo que al flashear la stock con el tolkit te resuelva nada ya que me parece que no restaura el sistema de ficheros por completo (solo ciertas particines como es el caso de /system)
Prueba con terminal emulator si lo tienes instalado a comprobar con df o mount
En todo caso seguro que algo se puede hacer pero lo desconozco. Lo mas practico es que pidas reemplazo estas en tu derecho ya que estabas restaurando el sistema y ya esta.
Edito: No te lee la tabla de particiones