A ver, flashtool viene con los drivers para flashear el terminal. Tienes que seleccionar los del terminal y ademas los que pongan fastboot y flasmode (o algo asi).
Luego cuando flasheas para que se realice bien, apaga el terminal y empieza a hacer los pasos todos del flashtool, y cuando te lo ponga en pantalla el dibujo para conectar, ahi lo conectas, porque el flastool funciona bien pero ese es el paso mas pijotero que tiene. Yo he tenido siempre algunos problemas en ese paso. Incluso hay veces que se pone en verde y al momento se pasa a modo carga, asi que insiste en ese punto.