Es que el cf-root cambia el kermel, para que seas root y no te cambie el kermel usa el cf-auto-root:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=619756
Después pasa de nuevo el triangle marcando la opción: Allow tracker to run.
Haz esto último del triangle primero a ver si te lo cambia a normal si no lo habías hecho antes y si no lo dicho rootea con el cf-auto-root o con framaroot si estas en 4.1.2