Eso es obvio amigo lo que pasa es que existen dos particiones en tu memoria, en pocas palabras haces una cada vez que le das un valor a la partición, si formates la sd no se regresa al valor original ya que solo estás formateando la partición principal. La solución es reconfigurar la sd con un programa como Partition Wizard ó partition magic donde borres la partición y el espacio de esta se lo des a la partición principal. Otra forma aunque no estoy muy seguro que funcione es desde el recovery en advanced y partition pero esto no recuerdo bien si lo soluciona.