Sigue las instrucciones de aquí:
http://forum.xda-developers.com/show....php?t=2186155
En nuestro S3 mini funciona perfectamente, básicamente instalas por CWM el archivo enable_custom_bootanimation.zip y al reiniciar ya tienes un bootanimation.zip en la carpeta System/media y éste lo puedes cambiar después por el que tú quieras.
Si quieres dejarlo como estaba al principio instala el disable_custom_bootanimation.zip
Creo que con el enable también te cambia el archivo poweron.ogg de System/media/audio/ui así que haz una copia del mismo por si no te gusta el cambio.