El razonamiento es correcto. Pero si tienes particiones en la SD, y usas el recovery de AMON_RA, tiene una opción que es el BART Backup. Con esta opción, te creará en la tarjeta SD una carpeta llamada "bart". Bien, si te guardas esta carpeta, y por ejemplo algo no te va bien, si haces un BART Restore te dejará el terminal tal y como lo tenías cuando hiciste el Backup: configuraciones, aplicaciones...etc
Lo de formatear la SD, en principio no hace falta a no ser que te encuentres con problemas de que no te acabe de ir bien la ROM.
