A mi me paso algo parecido con los drivers y lo que hice fue instalar estos (te paso los mios)
http://goo.gl/0kBF0 y ponerlos como compatibilidad de XP-SP3, tengo Win7, y fuera problema.
Por lo que yo puedo saber no es necesario que este sincronizado con Kies para que puedas "flashear" cualquier rom que sea compatible con tu dispositivo por Odin.