Como poder se puede algunas cosas no son faciles y ya n oseria una stock, seria una custom y casi seria mas facil instalar directamente una custom directamente que ir haciendo ingertos a una ROM instalada que al final te dara problemas.
Muchos MOD llevan cambios en ciertos archivos que estan dentro de apks compilados, o los cambias enteros con el riesgo que conlleva o los adaptas tu descompilando editando y volviendo a compilar.
Ahi MOD que te hacen el trabajo sucio pero tienes que segurarte muy bien que son de la misma base que tu ROM y que el desarrollador no es un chapuzas que le vale o a corto plazo tendras problemas (FC, lag, reinicios...).