Yo he tenido el mismo problema, al quitarle el root y reiniciar me seguia saliendo el estado modificado y sin poder actualizar por ota, lo que hice fué volver a rootearlo pero con la segunda opción, reinicio y vuelvo de desrootearlo con el framaroot de nuevo, vuelvo a reiniciar y ya lo tengo bien, me sale estado normal y ya puedo actualizar por ota.