Te refieres a la relación entre el porcentaje real y el icono de batería de la status bar?
Si es así, tienes que saber que dentro del systemUi (que es donde están estos iconos) hay 100 iconos diferentes. Uno para el 1%, otro para el 2%... pero estos iconos no son completamente diferentes. Por eso el grafico de esos iconos aunque esté al 95% se ve llena del todo.
Esto es suponiendo que tengas una rom modificada para que muestre los porcentajes de uno en uno. Si llevas una rom stock la diferencia aún será mucho mayor.
Pero no tiene nada que ver con la calibración de tu batería.
En ajustes/pantalla marcas lo de mostrar % y te pondrá el porcentaje real de batería.