Tienes el Recovery original u otro? De qué compañía eres?
1. Vale, el bootloader lo tienes desbloqueado, por lo que el siguiente paso sería instalarle un recovery. Bájate el Nexus que lo tienes por este foro. Luego, para ser ROOT, debes bajarte un ZIP del superuser (o cualquier otro) y flashearlo desde el nuevo recovery.
2. Que no seas ROOT no significa que no puedas instalar la actualización, es más, para instalar la actualización debes tener todo tal y como viene de fábrica, no hace falta ser ROOT, ni tener BOOTLOADER desbloqueado, ni nada, 100% de fábrica y actualizarás sin problemas siempre y cuando tu compañía ya haya lanzado JB. Es decir, ROM stock original de tu compañía y recovery original, con cualquier otro recovery o ROM que no sea original no vas a poder instalar ninguna actualización.
Te veo algo perdido, leete esto a ver si te aclaras un poco...
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=608002