Os recomiendo que utilicéis la ultima versión que es la 1.0.11, la podeis descargar de la página oficial que es esta.
http://apkmultitool.com/?q=node/5
El proceso de compilado y decompilado es un tema delicado, para hacerlo tenéis que instalar el SDK con todos los apis de 4.0 en adelante y tener instalada la ultima versión de java.
Intentaré seguir este hilo por si os puedo ayudar en lo que sea.
Saludos
