Si pones rom stock sobre stock no hay problemas casi nunca por lo que los wipes no son tan necesarios. De rom custom a custom o stock y al revez siempre e e recomendable.
Apenas que lo hagas por ti mismo para que te des cuenta. Generalmente siempre hay fallos porque los datos de sistema no son compatibles entre cada rom stock y custom, esto se traduce en cierre de aplicaciones de forma inesperada y masiva en casos muy graves.