Bueno, pues experimento hecho y con éxito. Formatee la sd interna desde TWRP y conservé la ROM
Lo sé porque luego arrancaba
Al reiniciar, en la pantalla de pedir el PIN, estaba mi fondo de pantalla y mis cosas de la barra de estado. No pasé de ahí: conecté al ordenador por USB, pasé rom, gapps y kernel y reinicié en recovery. Borré la carpeta Android que se había creado automáticamente, hice un factory reset e instalé los zips que había pasado.
Et voilá! ROM más limpita no se puede instalar, y sin pasar por stock! Si a alguien le sirve la info, que se anime!