Ya está claro, las rom JLB, a diferencia de las semanales de miui, van sin rootear, o sea sin la posibilidad de activar permisos root o de superusuario, son por tanto estables. Por tanto habrá aplicaciones que no funcionen (Titanium Backup, RootExplorer, etc). Ademas no podrás modificar las aplicaciones de sistema al no tener los permisos adecuados.
Con respecto a la diferencia entre esta jlb estable y una semanal 3.5.10 o similar, es que como bien dice la primera, es estable, o sea, más pulida, sin problemas aparentes. La semanal podría presentar algún bug, cosa que van arreglando cada viernes.
Esta situación hace que el sistema sea más seguro y estable sobre todo para usuarios sin experiencia.