No confundamos terminos, el roteo no tiene porque implicarse en nada con la bateria, a no ser que instalemos una rom o modifiquemos nosotros mismos la rom stock.
Para solucionar el problema con la bateria prueba a hacer wipe battery stats desde el recovery despues de cargar el movil al 100% o si el problema persiste vuelve a instalar la rom desde cero haciendo todos los wipes.