Si ya eres root instala titanium backup y desde ahi puedes desinstalar apps de system.... o si no te fias... congelarlas para que no funcionen pero las tendrás ahi y puedes volverlas hacer funcionar en caso de que falle el terminal.

Una lista? eso ya depende de cada uno...para mi gusto apps de system como Social Hub, music hub, samsung apps y etc no valen para nada.