Creo que no entiendo muy bien lo que dices... Si le flasheas otra barra desde recovery, se reemplazan los archivos y no hay que cambiar nada, si no que cuando abras STATUS BAR PREFERENCES se abriran los ajustes de la barra que hayas flasheado...
No se si es a lo que te refieres comoi, si no es asi perdona mi ignorancia, e,xplicame un poco mas lo que quieres hacer exactamente