Pues no parece que haya nada raro.
El EOS 4.2 casi 'requiere' TWRP' y lo has usado. El desarrollador recomienda hacer un Wipe completo al pasar de una ROM no EOS 4.2 a una 4.2. Para actualizar ya basta con un flasheo sucio (wipe system, flash, wipe caches y listo).
Un problema común era usar un recovery que no fuera TWRP. Surgían problemas con los datos multiusuario y se empezaban a crear 'directorios' con nombre 0 en los que se duplicaban los datos...
Sólo se me ocurre que reintentes a ver si hay suerte. O que te ayude alguien que sepa de verdad ;)