Como te comentaba no hay ninguna garantía de que funcione... yo creo que se te ha debido quedar algún resto de la rom anterior en la memoria interna, por eso yo probaría primero a hacer una copia de su contenido en el PC y luego formatearla desde el recovery.
Así después de una instalación limpia todo tendría que ir bien y ya podrías restaurar apps con Titanium o Go Backup (mejor sin datos, aunque todo es probarlo) y probar también a recuperar alguna carpeta si te interesa.