Pues si que es raro, porque yo he rooteado mi nexus y funciona todo perfectamente.
Sólo lo has rooteado o has instalado también alguna ROM modificada?, porque si has instalado una ROM, puede que ahí es donde esté el problema.
Intenta restablecer los ajustes de fábrica a ver si todo funciona, y luego hazte root únicamente, sin añadir nada más. Si todo funciona entonces es cosa de la ROM.