Buenas Muesly:
Bienvenid@ a este apartado de HTCMania y enhorabuena por la futura adquisición.

1.- Las ROM Stock para el Note 2 nada tienen que ver con las Gingerbread 2.3.6 con la cual "nos dejó tirados" (yo era un usuario - aún lo tengo -, del SGS), Samsung.
1-1.- Sí que le puedes poner una 4.2.2. Hay un hilo creado y mantenido (muy bien por cierto), por Alfista28 donde tienes todas las 4.2.2 que han salido, hasta ahora, para nuestros Note 2.
1-2.- Aunque no funcionen las aplicaciones originales en cuanto al S-Pen se refiere, hay otras apps que las suplen y con las cuales si funciona el mismo.
2.- Respecto a las recomendaciones, te invito a leer los distintos hilos que hay en este apartado, aunque hay uno con chincheta creado por Kazica donde tienes bastantes preguntas/dudas respondidas y enlaces a los hilos donde explican el como y que hacer al respecto.
SalU2.