A mi me paso esto justo el fin de semana y te voy a contar lo que hice yo..
Desde los repertorios de Google me baje la ROM Stock te dejo el link directo:
https://dl.google.com/dl/android/aos...y-345dc199.tgz
Después me baje el Nexus 4 ToolKit (La verdad es que ya lo tenia instalado cuando quise hacer el root) pero lo puedes bajar siguiendo este hilo:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=492792
Copias la ROM STOCK a la siguiente direccion:
C:\Google Nexus 4 ToolKit\put_google_factory_image_here
Abres el Nexus 4 ToolKit, escribes "no", después "1" y llegas al menu principal, tecleas la opcion "9" ("Download, Extract + Flash Google Factory Stock Rom") Seleccionas el "2 " y escribes "yes" para confirmar.
Ya con esto te instala La ROM Stock y el problema se soluciona ahora el paso siguiente es hacer el Root que en el mismo Neus 4 Toolkit en el menu principal es la opcion "8" sigues los pasos y te instalara el recovery y todo para que puedas meter la ROM que quieras.
Espero haberte ayudado.
Saludos