El método del rootexplorer es el más corriente. Luego hay apps que también sirven para eso como app2rom. Lo que pasa que el 100% de las apps no funcionan cuando las pasas al system...
Mueve el EXDialer, no hace falta que borres la otra (Y si luego no te funciona???). Luego, tu eliges la que quieres usar...
EN cualquier caso, NO recomiendo borrar nada del system si no se sabe muy bien lo que se está haciendo... Si borras la de contactos o el phone tendrás problemas.