Si hago instalación limpia pierdo los datos de la sd, como fotos o documentos y carpetas ?
No, no se pierde estos datos, sólo en caso de formatear la partición SD, se perderían, si se perderían las configuraciones de la anterior (sólo tendríamos que configurar cuentas de nuevo y personalización .
La instalación limpia siempre es la más aconsejada para instalar una nueva versión, aun viniendo de una versión anterior que también se podría haciendo sólo wipe caché y wipe dalvik e instalando encima, por que dejar residuos de la anterior ??
Para hacer limpia la instalación haremos desde Recovery; wipe caché / wipe dalvik / format system / format data / format caché por último, wipe data/factory reset
Después instalaremos la ROM y configuramos.
¡¡OJO!! Para no perder datos de la SD, lo único, no hacer en ningún caso es; format SD