No hay diferencias, si acaso, al instalar desde HTCSync, las aplicaciones las tienes en el PC y no en la tarjeta SD.
Las aplicaciones se instalan en la memoria del teléfono.
Un pequeño truquillo para tener muchas aplicaciones en tu Tattoo, sin que te coma memoria es tener los archivos .apk guardados en tu SD e instalarlos cuando te hagan falta. No se tarda más de 30 seg. en instalar una aplicación.
saludos.