hola,respondiendo a tus preguntas y si me equivoco que me corrijan,el led de notificaciones solo tiene el verde y naranja,en whatsapp yo al menos lo he configurado para que se encendiese en cualquier otro color y las notificaciones siguen apareciendo el led verde cuando recibo algo.
lo de que si se puede configurar para otras aplicaciones,realmente no te entiendo muy bien pero por mas que he indagado en los ajustes,no he encontrado nada referente para configurar el led.
y lo de los botones es debido a la cantidad de luz a la que el movil este exppuesto,es decir si en la habitacion en la que estas hay poca luz,los botones se iluminan y si enciendes la luz estos se apagan,si a ti no se te encienden ni sin luz ni con ella puede ser un fallo.
saludos