pedestre encontré algo que no se si sea un error es que al crear el script de inicio para aplicar las configuraciones del governor se genera el siguiente error:
sh: /etc/init.d/S999ApoloConf[33]: can't create /sys/devices/system/cpu/cpufreq/pegasusq/sampling_rate_min: Permission denied
Esto lo solucione modificando los permisos del sampling_rate_min rw-r-r hay algún problema con este cambio?