Cabe decir que al poner jb, si desbloqueas el bootloader para poder poner cwm y rootear se hace un factory reset, por lo que se borran las apps y la memoria interna.
Por lo menos eso leí, corregidme si me equivoco.
Yo hice el método de conservar el root en jb viniendo de una ics rooteada sólo por eso, aunque es bastante complicado hacerlo así.