Hola, no se si servirá de ayuda pero si te digo que todos los servidores de correo electrónico no funcional igual. Pero en la configuración de hotmail y creo que en gmail (dudo porque uso los dos servidores) en sus respectivas páginas web oficiales hay una opción para dar permiso a otras aplicaciones o servidores a controlar los mensajes. Es decir, que si desde tu teléfono borras el mensaje o lo abres, luego en el ordenador te aparecerá como borrado o leído. Pero por el contrario a no ser que se pueda cambiar la configuración en el teléfono, si tienes descargados mensajes en el teléfono y borras en el ordenador o en el teléfono directamente desde el servidor, se seguirán conservando los mensajes en tu teléfono ya que quedan almacenados a menos que los borres o cambies la configuración y cada vez que actualices la bandeja de entrada se quedará igual que la bandeja de entrada del servidor. ES un poco engorroso, pero todo depende de los servidores que uses y también de las aplicaciones que tengas instaladas en el teléfono. Bueno, espero esto te haya aclarado algo, un saludo