las baterias son insteligentes es decir que no guardan memoria como las antiguas baterias.
si deseas calibrar la bateria requieres que sea root y usar calibrate battery para hacer eso primero tienes que tener la bateria sin carga y dejar que cargue al maximo y despues tienes que tener la bateria al 100% y ademas usar la app y presionar calibrar la bateria y listo.
otra forma es hacer cargas parciales como lo estas haciendo,el hecho que este el led verde es porque ya llego al 90% y pues si se deja solo termina cargando al 100% para sacar provecho hay apps que te permite ahorrrar bateria y bueno mir2ruso me enseño una excelente app Juice Defender & Battery Saver y te dura mas la bateria.
la sincronizacion hace que gastes mas bateria por eso es bueno programarla que se actualize cada x tiempo entre mas largo es mejor,otra buena opcion es que si estas en la pc y estas trabajando y a lado esta el telefono puedes conectarlo a la pc y asi se estara recargando la bateria