No, no se pierde el Sense, lo único que sucede es que tras rotear sera como si restaures el teléfono a fabrica. O por lo menos eso me paso a mi, no se si fue al instalar el recovery o al instalar el root, más bien creo que fue al instalar el recovery. Otra cosa es que luego la lies y te lo cargues. Pero si haces un backup no tendrás más que restaurar