Hoy me ha pasado exactamente lo mismo, no tengo ninguna app conflictiva que haga que apague el teléfono cuando esta en inactividad (aún ni siquiera soy root). Me sucede siempre cuando lo tengo a baja batería, ayer por la noche, puse la alarma para levantarme hoy temprano (menos mal que me levanté sin la alarma), lo puse en modo avión y con un 20% de batería restante. Pues, cuando me levanto, veo que el teléfono estaba apagado, con la misma carga que la última vez.
Ya van dos veces que me ha pasado lo mismo. Se desconecta por la noche, cuando la batería es del 20% o menos, estando en modo avión.