Lo que yo he hecho ha sido escribir a mano el "1000", situado en la celda he clicado en "Format > Number > 1,000 Rounded", con lo que se ha establecido dicho formato y se ha insertado la coma. He copiado el formato de la celda y lo he pegado en la inmediata anterior (la del 999). A continuación he seleccionado las dos celdas (999 y 1,000) y he pinchado en la esquina inferior derecha y arrastrado hasta la última línea de la tabla, tal como haríamos en MS Excel (o haciendo doble click, en GDocs sólo funciona si las celdas están previamente vacías).
Pruébalo a ver si se te arregla ;)
