La diferencia en potencia está en que el procesador del Note2 es un cuatro núcleos 0.2 GHZ más rápido que el del S3 y tiene 2GB de Ram y el S3 solo tiene 1GB.
El Note2 tiene una batería de 3100mAh y el S3 de 2100mAh. También es verdad que el Note2 tiene un pantallón de 5.5 y el S3 de 4.8 pulgadas, asi que gastará más. Yo me pasaría por los subforos de los dos y buscaría un post que hay en el que ponen las estadísticas de consumos de batería y ver cual es más eficiente. Las pantallas, los dos tienen la misma resolución pero el Note2 al ser más grande tiene menos densidad de pixels y por tanto menor definición (aunque se ve espectacular).
También la decisión depende de lo que quieras como ha dicho stareduski. Si te llama más la atención el S-Pen coge el Note2; si quieres un trasto para poder manusearlo mejor coge el S3.
Espero ser de algo de ayuda. Saludos