A mi me pasaba algo similar, yo te lo comento por si te puede servir de ayuda. Yo usaba la app de correo electrónico con un correo de hotmail. Me di cuenta de que me borraba los mails, o al menos desaparecian. Así que buscando me percaté de que hotmail había creado una carpeta nueva llamada "POP" y ahí iba pasando todos los correos, es decir, no los borraba sino que los traspasaba a esa carpeta.
A lo mejor lo tuyo puede ser similar, espero ayudarte.