Como veo que algunos problemas son de restauración o backup, pondre algo de mi cosecha a ver si simplificamos el tema: El titanium es indudablemente la mejor herramienta y todos deberiamos tenerla comprada pero llevo varios años usandola y a veces da problemas en las restauraciones, no la voy a culpar de eso porque pequeños cambios en el framework de android pueden afectar a su funcionamiento con algunos programas y para eso estan las actualizaciones. Entonces uso tambien una herramienta más robusta pero menos fina ya que no restaura datos de usuario de los programas, pero los programas en si te los restaura siempre y es app backup and restore(gratuita) y la verdad es que ya practicamente no restauro datos, android ligerito va que vuela.
Si queremos restaurar datos y programas con una herramienta gratuita y solvente tambien podemos utilizar Mybackup root (gratuita)