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A mi me estaba pasando algo parecido pero no con la stock sino con la custom que uso, lo solucié haciendo un full wipe y volviendo a flashear la rom, en mi caso no me mostraba la carpeta donde el recovery guardaba mis copias de seguridad que hacia desde alli.

Ahora veo los archivos tanto desde la tablet como en el pc, la verdad es que no se que ocurrió, pero me pasó desde que pasé a la ultima versión de android, creo que se lia o algo al pasar de una versión a otra....

También tuve que actualizar el recovery, uso TWRP

Saludos.