Un par de datos más:
Encontré este software que hace lo mismo que el editor remoto de registry de Visual Studio (editar desde la PC)
http://mobile-registry-editor.softonic.com/pocketpc
Luego, la rotación la hace dejando los botones a la izquierda (90 grados sentido horario). Para que deje los botones a la derecha al rotar (90 grados sentido antihorario), modifiqué el valor de LanscapeMode de 0 a 4.
Por otro lado, si quieren que les arranque ya en modo apaisado, el ángulo se establece modificando el valor "Angle" (0 = normal) en 90, 180 ó 270 grados. He aquí la información sobre esto:
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/aa447504.aspx
saludos