Pues te comento compi, dentro del zip, en "META-INF/com/google/android/updater-script" hay una línea que es "delete("/system/app/CMWallpapers.apk");" que lo que hace es borrar la apk de los fondos animados (puedes ver el contenido del script abriendo el archivo con cualquier editor de texto) con lo cuál si borras esa línea, ya no te desinstalará esa apk, y así con el resto.
Gracias!
