mi consejo. igual q a abelbus me parece q te ocurre. deja solo una. utiliza solo una. se q va en contra de tu idea de tener varias pero me explico y comento por lo siguiente ;
pones la tuya de origen. lo mas efectivio es wipe batery. desde recovery. pero se hace y se qeda una bateriaa ( la de origen) se hace al 100 % de carga, se deja q se agote y se carga completa del tuiron.
ya tienes un ciclo no?
si metes una bateria no va a estar igual de carga nunca. siempre varia. asike ya el marcado de carga no es el acertado.
esta puede ser una causa posible de tu problema.