La causa, la desconozco...
Las posibles soluciones:
1 - Entrar en recovery y hacer wipe cache, wipe dalvik cache y fix permisions.
2 - Si no funciona, hacer un factory reset (ten en cuenta que perderás todas las aplicaciones de usuario).
3 - Si tampoco funciona, reflashear... pero esperemos no tener que llegar a eso.
¿Hay algún proceso en tu teléfono que se active por la noche?