Si, si ya tienes el kernel metido en el movil, al flashear la nueva rom solo tendrías que excluir el kernel (En el cuadro Exclude de la derecha Exclude Kernel) y tendras la rom que quieras con el mismo kernel
Si lo tienes suelto, primero asegúrate de que es original y no un kernel modificado ya que si no tienes el bootloader abierto y no es original puedes liarla