Bueno, he encontrado una solución: abrir el "Nota S" de Samsung, pulsar arriba a la derecha en el Menú y seleccionar "Importar", seleccionar PDF y marcarlo con un check en el explorador que aparece. Una vez importado se trabaja sobre él como si fuera una nota más, pudiendo de esta forma usar la opción "Solo Lápiz S" sin ningún problema. Además, aunque esté esa opción seleccionada, se puede hacer zoom y moverte por el documento haciendo pinza con los dos dedos, cosa que se agradece mucho