Mejor haz root con el mismo flashtool en el simbolo del candado una vez que hayas flasheado enciende el arc y dale en depuracion USB y conectalo normal el flashtool te te marcara el candadito en negro y le das y hara root automaticamente, (ojo nomas en el 4.0.2.A.0.42 se puede).
Para lo de la rom, hiciste full wipe?: (wipe data, wipe cache, wipe daklin cahe <- algo asi no recuerdo el nombre
y por ultimo format /system?)