Lo que yo hacía,era copiar las aplicaciones en una carpeta que creaba en la SD y le llamaba "Aplis" (puedes ponerle el nombre que quieras).Luego,una vez flasheada la rom,iba a la carpeta y las iba instalando una por una.
Sé que es algo engorroso pero de esta manera no instalaba los datos y si alguna me daba problemas,la desinstalaba,borraba los datos y carpetas,y luego la descargaba otra vez,haciendo una instalación limpia.
Espero haberte resuelto las dudas.
Un saludo
