Pregunta puede que tonta: ¿No tendrá nada que ver con el modo ahorro de energía, no? Lo digo porque el otro día un usuario posteó que en ese modo la alarma del teléfono se le retrasaba (o no sonaba).
A mi lo de sincronizar la hora en unos segundos también me pasa, pero como no uso la alarma del teléfono no sé si tendrá algo que ver.