Aqui tienes un tutorial de como flashear una room, rootear y liberar:
http://www.htcmania.com/showthread.php?t=432212
Lista de aplicaciones que se puedan borrar no hay.
Yo uso el titanium backup, y en lugar de desinstalar lo que hago es congelar, que es como desinstalar pero si algun dia quieres volver a usarlo descongelas la app y como que no hubiese pasado nada.
No hay roms oficiales superiores a 2.3.6