Pues lo que yo haria es lo siguiente:
Intenta montarle el nuevo recovery por Odin y le haces todos los wipes sin montar nada. deberia de solucionarse. Eso que dices me pasó las primeras veces que le monté roms.
Si no se soluciona y lo que dices es cierto de que el celular se deja montar programas pues metele el titanium backup y haces una copia de los programas con los datos.
Reinstala por Odin la Stock> Rootealo> montale el nuevo recovery> montale otra vez la Rom.
Espero te sirva.